Curso: Introducción al análisis bioinformático y técnicas moleculares
Objetivo general:
Conocer las principales herramientas y usos de la bioinformática en el campo de las ciencias biológicas.
Modalidad: Presencial.
Horas: 20.
Fechas: Del 07 al 11 de octubre de 2024.
Horario: 8:30 a 14:00 h
Lugar: Salón de Seminarios II, Edificio H y Laboratorio Divisional del Departamento
de Biología de la Reproducción R-016. UAM-Iztapalapa.
Temas
Sistema Operativo Linux
Uso de terminal de trabajo
Comandos básicos
Manejo de archivos
Bases de datos en NCBI, ENBLEBIy DDBJ
Obtención de secuencias vía terminal y línea de comandos
Formatos de archivos de genes
proteínas y genomas
Alineamiento de Secuencias
Programación Dinámica
Matrices de Sustitución
Alineación Global y local
Formatos de alineamientos
Programas para alinear con línea de comandos: ClustalW, Muscle y BLAST
Alineamiento de Secuencias
ClustalW, Muscle y BLAST
Análisis Filogenéticos
Principios de análisis filogenéticos
Modelos evolutivos para genes y proteínas
JmodelTest y ProTest3
Modelos de inferencia filogenética
Métodos de distancia
Máxima Parsimonia
Máxima Verosimilitud
Técnicas moleculares (teoría)
Marcadores moleculares
Reacción en cadena de la
polimerasa (PCR)
Electroforesis
Secuenciación
Técnicas moleculares (Práctica)
Extracción de ADN
PCR
Electroforesis
Requisitos de ingreso:
- Contar con Laptop
- Tener sistema operativo Linux instalado en PC, preferentemente UBUNTU
- Ser alumno(a), egresados de licenciaturas y posgrados de CBS, CBI e interesados en el análisis de secuencias de ADN.
Imparten:
Dr. Ahiezer Rodríguez Tobón.
Dr. Gerardo Figueroa Lucero.
